Le grosbec casse-noyaux a connu une très forte hausse d'effectif de 63% de 1979 à 2019 en France métropolitaine. Il est classé en préoccupation mineure sur les catégories de menace de la Liste Rouge nationale (UICN 2020).
Cette valeur est toutefois à nuancer car cette espèce fait partie de celles qui varient énormément d'un hiver à un autre, comme le pinson du Nord et le tarin des aulnes. Lors des 10 dernières années, on constate par exemple qu'il est quasiment absent une année sur deux et qu'il y a une moyenne de 5000 individus les autres années avec un pic à 15000 individus en 2018.