Le guêpier d'Europe a connu une énorme baisse d'effectif de 64,1% de 1979 à 2019 en France métropolitaine. Comme pour beaucoup d'espèces, la raréfaction de son environnement de reproduction et la chasse dont il victime en Afrique pendant son hivernage causent une grande partie de son déclin. D'autant plus que, victime de sa grande beauté et de son tempérament relativement peu farouche, la pression de l'homme (particulièrement celle des photographes avides et/ou ignorants), en vient à causer la fuite des colonies ou la destruction des nids, construits dans des berges sablonneuses des rivages, sous le piétinement incessant.
Il est classé en préoccupation mineure sur les catégories de menace de la Liste Rouge nationale (UICN 2020).
