Le verdier d'Europe a connu une très forte baisse d'effectif de 50%de 1979 à 2019 en France métropolitaine. La tendance se confirme dans les jardins où son effectif a baissé de 46% depuis 2013 d'après les 10 ans de suivi de l'observatoire des oiseaux du jardin. Comme pour beaucoup d'espèces, la dispartion de son environnement et les pratiques agricoles destructrices expliquent son déclin. A cela s'ajoute une maladie qui touche son espèce, la trichomonose aviaire, qui se propage notamment dans les mangeoires sales.
Il est classé en vulnérable sur les catégories de menace de la Liste Rouge nationale (UICN 2020).
